Wenn der eSATA-Controller vom BIOS gesteuert wird (bootfähiges eSATA), dann geht das.
Bei der Installation kannst Du auswählen (bei der Partitionierung unter "erweitert"), wohin GRUB geschrieben wird.
Wenn der GRUB erstmal auf der eSATA-Platte/Partition ist, dann zeigt er sich auch nur, wenn Du von der Externen bootest
Greetz
REINERV