Moin!
"wenn man bei einer Neuinstallation (z.B. neue LTS Version) oder einem Upgrade (16.04.2 auf 16.04.3), unter "etwas Anderes", die /home Partition mit formatiert und von der Installation "
1. Bei einem Upgrade bleibt (eine separate) /home unangetastet
2. Von 16.04.2 auf 3 ist kein Upgrade. Der "Status" wird durch die ganz normalen Updates von 2 auf 3 angehoben.
Ansonsten kann ich dir keine abschließende Antwort geben. Wenn du wissen willst, was da alles vertreten ist, öffne den /home Ordner, stelle oben bei Ansicht auf "versteckte Dateien anzeigen" ein, und schau nach. Wenn ich z.B. eine Neuinstallation mache, ist das erste, dass ich hier die neuen mozilla und Thunderbird Ordner lösche (falls vorhanden) und die gesicherten rein kopiere. Damit werden (fast) alle Daten und Einstellungen übernommen. Andere (versteckte) Ordner müsste man ggf. separat betrachten. Bei irgendwelchen .gnome Ordnern z.B. wäre ich vorsichtig, die einfach so zu übernehmen. Ist bei der neuen Installation ein Ordner gleichen Namens vorhanden, diesen unbedingt sichern, bevor der alte oder Inhalte daraus verwendet werden.
Ich nehme mir bei einer Neuinstallation auf dem hauptsächlich genutzten Produktivsystem, alle 2 Jahre einfach die Zeit, alles neu einzurichten um möglichst wenig Altlasten mit zu schleppen.
Gruß